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三代宏基因組測(cè)序

瀏覽次數(shù):1177|來(lái)源:飛凡檢測(cè) | 2022-03-02 10:56:44

宏基因組學(xué)(Metagenomics)又叫元基因組學(xué)、微生物環(huán)境基因組學(xué)。是直接從特定環(huán)境樣本中提取全部微生物的總DNA(也稱(chēng)宏基因組,metagenome),對(duì)其進(jìn)行高通量測(cè)序、序列組裝和基因注釋?zhuān)@得環(huán)境微生物基因組信息總和,以研究環(huán)境微生物的群落結(jié)構(gòu)、物種分類(lèi)、系統(tǒng)進(jìn)化、基因功能以及代謝通路等。擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術(shù)限制,在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優(yōu)勢(shì),其應(yīng)用滲透到各個(gè)領(lǐng)域, 包括醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、畜牧、環(huán)境等。

近年來(lái),新一代測(cè)序技術(shù)(Next Generation Sequencing)的發(fā)展使研究宏基因組的方法也已經(jīng)發(fā)生了變化,人們可以較快速準(zhǔn)確的得到大量生物數(shù)據(jù)和豐富的微生物研究信息,從而成為研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。伴隨著PacBio測(cè)序平臺(tái)的問(wèn)世,宏基因組學(xué)的研究又增加了一個(gè)有力的研究途徑,其長(zhǎng)讀長(zhǎng)、無(wú)GC偏向和無(wú)PCR擴(kuò)增等優(yōu)勢(shì)可以獲得更多信息,避免二代測(cè)序技術(shù)在面對(duì)復(fù)雜微生物群落時(shí)的瓶頸:因讀長(zhǎng)短、不能跨越重復(fù)序列、高GC含量序列等,無(wú)法真正揭示菌群的復(fù)雜情況。

利用三代實(shí)時(shí)單分子測(cè)序PacBio SMRT技術(shù),我們可以獲得更多基因組信息,更準(zhǔn)確的物種分類(lèi),更多的物種鑒定,較為全面地刻畫(huà)微生物群落各方面的特性,可最真實(shí)的還原環(huán)境中微生物群落信息,從而深入探討它們對(duì)于整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)的重要意義。

技術(shù)流程

技術(shù)流程

數(shù)據(jù)分析

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樣本要求

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技術(shù)參數(shù)

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