全長16S/18S/ITS擴增子測序

目前，16S/18S/ITS rRNA是微生物分類鑒定和系統(tǒng)發(fā)育的指標。原核微生物的16S rRNA基因長度約為1500 bp，包含10個保守區(qū)和9個高變區(qū)（V1-V9），同時具有高度的保守性和特異性，保守區(qū)可反映菌屬間的親緣關(guān)系，可變區(qū)體現(xiàn)菌屬之間的差異。真核微生物18S rRNA基因長度約為1500~2000 bp，序列中也既有保守區(qū)和可變區(qū)，由于進化速率比較保守，適用于種級以上的分類鑒定。真核微生物ITS長度約為500 bp，在種內(nèi)不同菌株之間高度保守，而在菌種間存在較大的變化，表現(xiàn)出極大的序列多態(tài)性，被廣泛應(yīng)用于生物種間系統(tǒng)發(fā)育和研究。

既往的16S/18S/ITS rRNA擴增子測序針對其序列的單個或連續(xù)的兩個或三個可變區(qū)設(shè)計引物擴增再測序分析；而現(xiàn)在基于三代PacBio SMRT測序平臺，我們使用27F/1492R的引物，平均讀長10~18 K，可輕松覆蓋16S/18S/ITS rRNA全長序列，突破二代測序讀長短的局限性，實現(xiàn)精確到“種”的分類鑒定，可在多個領(lǐng)域應(yīng)用如物種進化、物種豐度、環(huán)境與生態(tài)、醫(yī)學領(lǐng)域等，研究表皮微生物的關(guān)系、人體腸道微生物與疾病。

技術(shù)流程

數(shù)據(jù)分析

我們使用Circular Consensus Sequencing（CCS）的算法來矯正測序產(chǎn)生的錯誤，提高測序的準確性。通過去除barcode以及長度小于150 bp以及模棱兩可的序列，通過99%的相似性產(chǎn)生OTU和比對數(shù)據(jù)庫最后進行分類。

樣本要求

技術(shù)參數(shù)

飛凡檢測質(zhì)檢報告流程：

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  1、 提供產(chǎn)品資料

• 2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測項目，并給出報價

• 3、 確認報價沒有問題，然后把樣品送到我們實驗室

• 4、 支付檢測費用，安排檢測

• 5、檢測完成，出具檢測報告，郵寄給客戶

• 咨詢熱線：18018131362

• 關(guān)于飛凡

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飛凡檢測致力于打造國內(nèi)專業(yè)的第三方檢測服務(wù)公司，不斷優(yōu)化整合市場檢測資源，飛凡檢測與多家科研院所，如上海同濟大學，蘇州大學，SGS，TUV，以及國內(nèi)眾多知名的檢測公司進行深度合作，共同為國內(nèi)制造業(yè)服務(wù)，為中國的制造業(yè)開拓海外市場保駕護航，為我們?nèi)粘Ｉ畹慕】蛋踩珮淞藯U；公司目前工程師百余人，95%以上是本科以上學歷；我們合作的實驗室通過CNAS，CMA（EZ），所出具的任何一張報告都有CNAS，CMA資質(zhì)，確保出具的每份報告都具有權(quán)威的法律效力。

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• 為什么選擇我們

• 市場需求和成熟的模式給了我們成功的保證

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